Административное управление
Департамент финансов и экономической политики
Департамент автомобильных дорог
Департамент капитального строительства и инвестиционной политики
Контрольно-ревизионный отдел
Отдел правовой работы и управления Государственной собственностью
Отдел управления персоналом и социальным вопросам
Отдел внешнеэкономической деятельности
Отдел методологии бухгалтерского учета и отчетности
Режимно-секретная работа
Связи с общественностью
Сектор информационных технологий
Сектор методологии и организации тендеров
Сектор мобилизационной работы
Сектор охраны труда
Сектор по подготовке к Евро-2012
Сектор энергосбережения и мониторинга ресурсов
Управление научно-технической политики