Департамент государственного регулирования внешнеэкономической деятельности
Департамент государственной политики в сфере внешней торговли
Департамент государственных закупок и государственного заказа
Департамент двустороннего торгово-экономического сотрудничества
Департамент документального обеспечения, взаимодействия с органами законодательной и исполнительной власти и общественностью
Департамент инвестиционной и инновационной политики
Департамент информатизации
Департамент кадрового обеспечения и прохождения государственной службы
Департамент координации региональной экономической политики
Департамент макроэкономики
Департамент международной технической помощи и сотрудничества с международными финансовыми организациями
Департамент обеспечения работы Министра (патронатная служба)
Департамент по вопросам торговой защиты
Департамент правового обеспечения
Департамент развития секторов экономики
Департамент развития социальной и гуманитарной сферы
Департамент регуляторной политики
Департамент реформирования публичной администрации и управления изменениями
Департамент сотрудничества с Европейским Союзом
Департамент стратегических инфраструктурных проектов и содействие их реализации
Департамент стратегического планирования развития экономики
Департамент торгово-экономических отношений со странами СНГ и Российской Федерацией
Департамент торговых переговоров и сотрудничества с ВТО
Департамент управления и реформирования объектов государственной собственности
Департамент финансовой политики
Департамент ценовой политики и ценового регулирования
Департамент экономики обороны и безопасности
Департамент экспертизы и анализа эффективности государственной поддержки
Другие самостоятельные подразделения
Финансово-хозяйственный департамент