Департамент адміністративно-господарського забезпечення
Інформаційно-довідковий департамент державної податкової служби
Головне управління податкової міліції
Департамент боротьби з відмиванням доходів, одержаних злочинним шляхом
Департамент відомчого контролю
Департамент взаємодії із засобами масової інформації та громадськістю
Департамент контролю за виробництвом та обігом спирту, алкогольних напоїв і тютюнових виробів
Департамент обслуговування платників податків
Департамент оподаткування фізичних осіб
Департамент оподаткування юридичних осіб
Департамент персоналу
Департамент погашення податкового боргу
Департамент податкового контролю
Департамент правової роботи
Департамент прогнозування, аналізу, обліку та звітності
Департамент розвитку та модернізації державної податкової служби
Департамент стратегічного аналізу та планування
Департамент фінансування, бухгалтерського обліку та звітності
Департамент інформатизації та обліку платників податків
Організаційно-розпорядчий департамент
Управління міжнародних зв’язків
Управління охорони державної таємниці та технічного захисту інформації