Товариство засноване 23 вересня 2000 року з ініціативи групи науковців у складі І. Баладинської, С. Рудницького, Н. Сейко. Місією товариства була і залишається надалі інтелектуальна підтримка поляків Житомирщини шляхом реалізації наукових, освітніх, інформаційних, культурних та видавничих проектів.

В період з 23.09.2000 р. до 12.11.2006 року головою організації був Сергій Рудницький. 12 листопада 2006 року ІІІ Зїзд товариства обрав нового голову – Ірину Першко, правління, затвердив список членів організації. 16 червня 2009 року Ірина Першко перестала виконувати обов’язки голови за власним бажанням.

В теперішній час обов’язки голови Польського наукового товариства в Житомирі виконує к.п.н. Ірина Баладинська. На сьогодні товариство нараховує 44 члени з України, Польщі та Франції.

3 жовтня 2009 року має відбутися IV з’їзд товариства, на якому буде обраний новий голова і затверджені нові члени товариства.

На сьогодні у склад правління входять: к.п.н. Ірина Баладинська, к.і.н. Олександр Буравський, к.філ.н. Сергій Рудницький, к.пс.н. Олександр Музика, к.п.н. Наталія Сейко і к.ф.-м.н. Олег Герус.